UNC 연구소는 유전자 서열 분석을 사용하여 코로나19 유발 바이러스의 비밀을 밝히고 있습니다.
게시 날짜:채플힐 – A 발표된 연구 ~에 셀 보고서 차세대 유전자 서열 분석이 어떻게 SARS-CoV-2 바이러스의 돌연변이를 추적할 수 있는지 보여줍니다. 이는 실제로 전염 추적, 진단 테스트 정확도 및 백신 효과에 도움이 될 수 있습니다.
UNC 의과대학 미생물학 및 면역학 교수이자 해당 연구의 수석 저자인 Dirk Dittmer 박사는 “NGS(차세대 염기서열분석)를 통해 바이러스의 유전적 서열을 파악하면 더 많은 질문을 시작할 수 있습니다.”라고 말했습니다. . “이런 정확한 순서를 이전에 어디서 본 적이 있나요? 다른 주나 국가에서 왔나요? 이 환자는 언제 그곳으로 여행을 갔으며, 또 누가 감염되었을 수 있습니까?”
Dittmer는 이러한 유형의 바이러스 모니터링이 진단 테스트에서도 중요하다고 말합니다. COVID-19를 진단하기 위해 개발된 테스트의 대부분은 새로운 코로나바이러스를 유발하는 유전자 서열의 한 부분을 찾습니다. 해당 서열에 돌연변이가 생기면 테스트는 더 이상 정확하지 않으며 결과에 영향을 미칩니다. Dittmer는 자신의 연구에서 그의 팀이 바이러스의 유전자 서열에서 변이를 발견했지만 다행스럽게도 일반적인 진단 테스트에서 표적으로 삼은 바이러스 부분에는 변이가 발견되지 않았다고 말했습니다.
“우리는 미래의 돌연변이에 대해 우려하고 있습니다.”라고 Dittmer는 말했습니다. “변이되는 것은 바이러스의 본성입니다. 유전자 서열의 다른 영역의 변화는 테스트를 방해할 뿐만 아니라 백신의 효과도 방해할 수 있습니다.”
이것이 바로 Dittmer의 연구실이 UNC-Chapel Hill의 다른 여러 연구실과 협력하여 테스트 프로토콜과 가능한 백신 개발에 변경 사항이 필요한지 여부에 대한 최신 정보를 유지해 온 이유입니다. Dittmer의 연구실은 UNC의 코로나19 진단 테스트가 개발되어 3월 16일 실시된 UNC 의료 센터 미생물학 및 분자 미생물학 연구소 소장인 Melissa Miller 박사의 연구실에서 SARS-CoV-2 양성 샘플을 받았습니다.
"우리는 바이러스에 대한 하나의 유전자 서열만을 보고 있기 때문에 우리는 우리의 테스트가 여전히 신뢰할 수 있다는 것을 확신할 수 있도록 이 유전자 서열의 변화를 지속적으로 모니터링할 것이라고 FDA에 말했습니다."라고 공동 연구원인 Miller는 말했습니다. 연구의 저자. “NGS가 우리가 그렇게 하는 데 도움이 될 것입니다.”
Dittmer의 최근 연구는 교외 및 농촌 지역사회에 초점을 맞춘 최대 규모의 연구입니다. 연구자들은 3차 임상 치료 센터인 노스캐롤라이나주 채플힐에 있는 UNC 메디컬 센터에서 관찰된 사례의 돌연변이 환경을 재구성할 수 있었습니다. 3월 30일부터 5월 8일까지 코로나19 확진 환자의 검체 175건을 분석했습니다.
테스트된 샘플 중 57%에는 유사한 연구에서 언급된 스파이크 D614G 변종이 포함되었습니다. 이 변종의 존재는 더 높은 게놈 사본 수와 관련이 있으며 전염병 전반에 걸쳐 그 유병률이 확대되었습니다. 이 샘플에서 발견된 유전적 변이는 노스캐롤라이나 사례의 대부분이 해외가 아닌 미국 내에서 여행하는 사람들에게서 발생했다는 가설을 뒷받침합니다.
UNC-Chapel Hill에 기반을 둔 NC Policy Collaboratory의 보조금을 받아 Dittmer의 연구실은 계속해서 NGS를 사용하여 2020년 남은 기간 동안 SARS-CoV-2 바이러스를 추적할 것입니다. 목표는 독감 또는 호흡기 질환이 있는 UNC 병원의 모든 환자를 등록하는 것입니다. 코로나19 진단검사 증상. 이러한 샘플은 서열 분석 및 수집되어 환자가 보유하고 있는 모든 바이러스에 대한 포괄적인 프로필을 형성하며, 이 정보는 SARS-CoV-2 및 잠재적으로 새로운 코로나바이러스에 맞서 싸우는 연구자 커뮤니티에 계속 도움이 될 것입니다.
Dittmer는 UNC Lineberger 종합 암 센터의 회원이기도 합니다. 이 연구의 공동 저자로는 Ralph Baric, Ryan McNamara, Carolina Caro-Vegas, Justin Landis, Razia Moorad, Linda Pluta, Anthony Eason, Cecilia Thompson, Aubrey Bailey, Femi Cleola Villamor, Philip Lange, Jason Wong, Tischan Seltzer, Jedediah가 있습니다. Seltzer, Yijun Zhou, Wolfgang Vahrson, Angelica Juarez, James Meyo, Tiphaine Calabre, Grant Broussard, Ricardo Rivera-Soto, Danielle Chappell 및 Blossom Damania는 모두 UNC-Chapel Hill 소속입니다.
이 작업은 DPD에 대한 공중 보건 서비스 보조금 CA016086, CA019014 및 CA239583의 지원을 받았습니다. 대학 암 연구 기금과 UNC 의과대학에서도 자금을 지원했습니다.
(다) 유엔사
원본 기사 출처: WRAL TechWire